自从空间殖民化开始以来，人类人口一直暴露在各种极端的环境条件下。大多数历史悠久的人类世界的人口都具有独特的身体特征，如显性发色、体形或身高。而身体适应的极端情况产生了不再是人类的突变种群。有些人在思想和灵魂上是如此令人发指的堕落，以至于审判庭认为他们光或者就过于危险了，并无情地清除了整个世界来进行重新殖民。
变种人在帝国中的地位因世界不同而不同。在许多原始世界，他们一出生就被杀死。在技术更先进的世界上，他们可能被允许生存，但很少享有世界上其他主体的权利。在许多世界上，他们与正常人口隔离，被视为非法，或被禁止生活在某些地区。一般来说，他们在帝国中形成了一个巨大的被压迫的部分。他们的不满偶尔会爆发为叛乱，而叛乱偶尔会让变种人在短时间内控制星球甚至是星群。然而，通常情况下，报复是迅速和无情的。
变异被广泛认为是一种应该被压制的偏差的标志。然而，有些突变并不立即显现，在这种情况下，突变者可能会上升到社会或军事的突出地位。当这种情况发生时，个体可能会有足够的力量来维持他们的地位，尽管他的变异早已广为人知。
亚人是由人类演化而来的生物--但其或多或少地被改变或变异。他们与普通变种人的不同之处在于，他们符合受认可的身体标准，能正常繁殖，并且不比正常人更容易进一步变异。在帝国内生活着数以百万计的这种生物，他们像其他人口一样被当局容忍或利用。亚人很少能在帝国的等级制度中获得权力地位，并且许多形式的亚人都会受到民众的嘲笑、恐惧或偏见的影响。他们被招募到军队、舰队、和其他部门之中（尽管不会成为星际战士）。在帝国卫队等机构中，他们往往被置于不同的群体中，与其他人类隔离。